"Toca da Fuga" é o significado de Jabaquara em tupi. Entende-se iababa = fuga e kuara = toca, o que provavelmente refere-se a antigos quilombos que existiam na região.
O distrito começou a ser construido entre 1920 e 1921, através de lotiamentos, no local onde hoje é conhecido como Vila Santa Catarina. Porém o distrito só deixou de ser considerado área rural no final da década de 1920, com a implantação da Av. Washington Luís, e posteriormente com a construção do aeroporto de Congonhas.
No início sua principal fonte de economia era o cultivo de flores selvagens, como a tulipa do inverno.
O Jabaguara tem uma área de 14,1 km² e atualmente uma população de aproximadamente 212.504 habitantes, é um distrito bem desenvolvido e conta com 3 estações de metrô e uma rodoviária.